A Loxone App a rendszer napi kezelőfelülete. Helyiségek és kategóriák szerint rendezve mutatja a világítást, az árnyékolást, a fűtést, a zenét és a biztonsági funkciókat, így a lakó ugyanazt a logikát éri el telefonról, tabletről vagy számítógépről.
Az alkalmazás otthon, a helyi hálózaton közvetlenül a Miniserverrel beszél, házon kívülről pedig a Loxone távoli elérésén keresztül. A felhasználói jogosultságok döntik el, ki mit lát: a gyerek profilja például csak a saját szobáját kapja meg, a vendég pedig egyetlen funkciót.
A kezelőfelület felépítése a Loxone Configban készül, tehát nem kötelező mindent kirakni: a jól összerakott rendszerben a legtöbb funkció magától megy, az appban csak az marad, amit tényleg kézzel akarunk állítani.